Ciente da necessidade de gerar maior inclusão comunitária e conferir sentimento de pertença do projecto EMIS às comunidades locais, a SAUDIGITUS firmou parcerias estratégicas com organizações locais para conjugar esforços na implantação do projecto. Na província de Nampula a parceria foi firmada com a associação UATAF-AFC e na província da Zambézia com a associação MUKALELO.

A UATAF-AFC é uma Associação que está vocacionada no fortalecimento de competências das comunidades, através de acções de educação e mobilização social, com vista ao aumento de conhecimentos e práticas que contribuem para a melhoria da qualidade de vida de famílias e indivíduos. Por sua vez, a associacao MUKALELO é uma organização que visa acelerar os mecanismos para a redução da morbi-mortalidade dos adolescente e jovens por HIV-SIDA, casamento prematuro, gravides precoce e indesejada, aborto inseguro e violência sexual, tendo a maior parte do seu público a frenquentar institucies de ensino, ou seja, nas escolas.

As duas organizações trabalham como parceiras de implementação do EMIS nas províncias em que estão sediadas e olham para o projecto EMIS como uma oportunidade de contribuir para a melhoria da educação em diversas facetas como resultado do uso de dados de qualidade sobre a situação da educação em Moçambique.